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在滅菌監測領域，生物監測同物理監測、化學監測一起作為無菌物品放行的依據。由于生物監測含有高抗力的微生物（芽孢），可以直接反映滅菌過程對微生物的殺滅能力，權威機構認為生物監測是最接近理想的滅菌監測過程；同化學監測相比，生物監測可以發現滅菌過程的微小失敗，如溫度低、空氣去除不徹底或超高熱；無菌保證水平SAL只有通過生物指示物來計算，任何化學指示物都無法計算。因此無論何種化學指示物都不能代替生物指示物用于滅菌過程的驗證，生物監測又被稱為滅菌監測的“金標準”。
目前來說，生物指示劑主要包括自含式普通型生物指示劑和自含式快速型生物指示劑，接下來就以3M生物指示劑為例，來談談生物監測的原理、結果判讀和相關的注意事項。
一、自含式生物指示劑結果判讀
1. 自含式普通型生物指示劑，內含有高抗力的芽孢。芽孢在復蘇、增值過程中，會產生酸性代謝產物，由于培養基中含有pH敏感的染料，在酸性條件下就會變成黃色。自含式普通型生物指示劑的結果判讀見附表1，在培養過程中必須設置陽性對照，即未經滅菌暴露的生物指示劑。設置陽性對照的意義在于確保培養條件和芽孢的發育能力正常，只有陽性對照為陽性，生物監測的結果才是有效的。
表1. 普通型生物指示劑結果判讀
注意事項：
每天必須用同批次作為陽性對照（若一天之內多個鍋次進行生物監測，且為同批次，陽性對照可只做一次），且只有陽性對照管為陽性，其生物監測才算有效；
陽性對照為陽性，滅菌管為陰性，生物監測合格。
陽性對照為陽性，滅菌管為陽性，生物監測不合格
陽性對照為陰性，滅菌結果無效，可能的原因為：培養條件不符合要求；生物指示劑有問題（應及時查出陰性原因）。
2. 自含式快速型生物指示劑的原理與普通型有所不同。菌株在增殖過程中，會分泌葡萄糖苷酶，該酶會特異性的分解培養液中非熒光底物，釋放出熒光物質，配套的自動閱讀器就可以探測出熒光，給出生物培養結果。由于酶具有高效性和專一性，在早期菌株增殖過程中就可以靈敏地探測到結果，因此快速型生物指示劑得到結果的時間明顯比普通型生物指示劑短。快速性生物指示劑具有高度靈敏性和準確性，用戶完全沒有必要進行延長培養。結果判讀見附表2，同普通型生物指示劑相類似，培養過程必須設置陽性對照，陽性對照培養結果為陽性才有效。
表2. 快速型生物指示劑結果判讀
注意事項：
需在3M配套培養閱讀器（290/290G或390/390G）中進行培養并讀取結果（圖1、圖2）；
每天必須用同批次作為陽性對照（若一天之內多個鍋次進行生物監測，且為同批次，陽性對照可只做一次），且只有陽性對照管為陽性，其生物監測才算有效；
陽性對照為陽性，滅菌管為陰性，生物監測合格。
陽性對照為陽性，滅菌管為陽性，生物監測不合格。
陽性對照為陰性，滅菌無效，可能的原因為：培養條件不符合要求；生物指示劑有問題（應及時查出陰性原因）。
由于3/4小時機器閱讀結果具有高度準確性，用戶完全可以根據3/4小時結果來判斷是否達到滅菌合格，不必進行延長培養。
圖1 290/290G結果閱讀示意圖
圖2 390/390G結果閱讀示意圖